Protein–RNA interactions for Protein: Q10713

PMPCA, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCAQ10713 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMPCAQ10713 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMPCAQ10713 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMPCAQ10713 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMPCAQ10713 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMPCAQ10713 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMPCAQ10713 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMPCAQ10713 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PMPCAQ10713 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMPCAQ10713 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMPCAQ10713 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMPCAQ10713 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMPCAQ10713 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMPCAQ10713 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMPCAQ10713 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PMPCAQ10713 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMPCAQ10713 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PMPCAQ10713 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMPCAQ10713 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMPCAQ10713 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PMPCAQ10713 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PMPCAQ10713 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMPCAQ10713 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PMPCAQ10713 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
PMPCAQ10713 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PMPCAQ10713 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PMPCAQ10713 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PMPCAQ10713 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMPCAQ10713 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMPCAQ10713 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMPCAQ10713 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMPCAQ10713 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMPCAQ10713 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMPCAQ10713 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMPCAQ10713 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMPCAQ10713 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMPCAQ10713 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMPCAQ10713 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PMPCAQ10713 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMPCAQ10713 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMPCAQ10713 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMPCAQ10713 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMPCAQ10713 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms