Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NCBP1Q09161 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NCBP1Q09161 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms