Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNP2Q05952 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms