Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RELAQ04206 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RELAQ04206 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RELAQ04206 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RELAQ04206 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RELAQ04206 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RELAQ04206 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RELAQ04206 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RELAQ04206 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RELAQ04206 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RELAQ04206 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RELAQ04206 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RELAQ04206 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RELAQ04206 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RELAQ04206 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RELAQ04206 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RELAQ04206 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RELAQ04206 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RELAQ04206 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RELAQ04206 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RELAQ04206 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RELAQ04206 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RELAQ04206 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RELAQ04206 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RELAQ04206 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RELAQ04206 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RELAQ04206 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RELAQ04206 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RELAQ04206 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RELAQ04206 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RELAQ04206 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RELAQ04206 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RELAQ04206 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RELAQ04206 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RELAQ04206 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RELAQ04206 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RELAQ04206 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RELAQ04206 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RELAQ04206 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RELAQ04206 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RELAQ04206 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RELAQ04206 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RELAQ04206 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RELAQ04206 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RELAQ04206 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RELAQ04206 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RELAQ04206 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RELAQ04206 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RELAQ04206 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RELAQ04206 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RELAQ04206 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RELAQ04206 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RELAQ04206 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RELAQ04206 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RELAQ04206 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RELAQ04206 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RELAQ04206 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RELAQ04206 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RELAQ04206 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RELAQ04206 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RELAQ04206 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RELAQ04206 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RELAQ04206 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RELAQ04206 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RELAQ04206 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RELAQ04206 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RELAQ04206 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RELAQ04206 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RELAQ04206 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RELAQ04206 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RELAQ04206 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RELAQ04206 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RELAQ04206 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RELAQ04206 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RELAQ04206 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RELAQ04206 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RELAQ04206 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RELAQ04206 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RELAQ04206 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RELAQ04206 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RELAQ04206 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RELAQ04206 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RELAQ04206 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RELAQ04206 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RELAQ04206 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RELAQ04206 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RELAQ04206 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RELAQ04206 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RELAQ04206 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RELAQ04206 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RELAQ04206 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RELAQ04206 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RELAQ04206 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RELAQ04206 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RELAQ04206 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RELAQ04206 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RELAQ04206 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RELAQ04206 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RELAQ04206 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RELAQ04206 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms