Protein–RNA interactions for Protein: Q02543

RPL18A, 60S ribosomal protein L18a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18AQ02543 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms