Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLCB3Q01970 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLCB3Q01970 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PLCB3Q01970 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLCB3Q01970 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLCB3Q01970 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLCB3Q01970 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLCB3Q01970 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLCB3Q01970 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLCB3Q01970 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLCB3Q01970 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLCB3Q01970 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLCB3Q01970 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLCB3Q01970 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLCB3Q01970 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms