Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FANCCQ00597 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FANCCQ00597 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FANCCQ00597 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms