Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPCAP84074 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPCAP84074 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPCAP84074 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPCAP84074 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPCAP84074 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPCAP84074 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPCAP84074 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPCAP84074 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPCAP84074 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPCAP84074 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPCAP84074 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPCAP84074 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPCAP84074 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPCAP84074 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPCAP84074 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPCAP84074 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPCAP84074 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPCAP84074 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPCAP84074 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPCAP84074 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPCAP84074 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPCAP84074 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPCAP84074 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPCAP84074 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPCAP84074 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPCAP84074 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPCAP84074 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPCAP84074 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPCAP84074 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPCAP84074 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HPCAP84074 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HPCAP84074 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HPCAP84074 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HPCAP84074 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPCAP84074 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPCAP84074 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPCAP84074 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPCAP84074 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPCAP84074 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPCAP84074 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPCAP84074 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPCAP84074 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPCAP84074 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPCAP84074 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPCAP84074 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HPCAP84074 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPCAP84074 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPCAP84074 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPCAP84074 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPCAP84074 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPCAP84074 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPCAP84074 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPCAP84074 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPCAP84074 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPCAP84074 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPCAP84074 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HPCAP84074 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPCAP84074 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPCAP84074 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPCAP84074 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPCAP84074 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPCAP84074 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPCAP84074 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPCAP84074 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPCAP84074 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPCAP84074 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPCAP84074 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPCAP84074 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPCAP84074 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPCAP84074 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPCAP84074 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPCAP84074 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPCAP84074 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPCAP84074 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPCAP84074 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPCAP84074 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPCAP84074 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HPCAP84074 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HPCAP84074 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HPCAP84074 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPCAP84074 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPCAP84074 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPCAP84074 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPCAP84074 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPCAP84074 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPCAP84074 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPCAP84074 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPCAP84074 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HPCAP84074 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPCAP84074 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPCAP84074 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HPCAP84074 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPCAP84074 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPCAP84074 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPCAP84074 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPCAP84074 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPCAP84074 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPCAP84074 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HPCAP84074 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms