Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX1P83916 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX1P83916 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX1P83916 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX1P83916 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX1P83916 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX1P83916 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX1P83916 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX1P83916 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX1P83916 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX1P83916 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX1P83916 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX1P83916 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX1P83916 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX1P83916 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX1P83916 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX1P83916 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX1P83916 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX1P83916 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX1P83916 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBX1P83916 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBX1P83916 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX1P83916 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX1P83916 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX1P83916 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX1P83916 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX1P83916 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX1P83916 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX1P83916 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX1P83916 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX1P83916 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX1P83916 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX1P83916 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX1P83916 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX1P83916 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX1P83916 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX1P83916 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX1P83916 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX1P83916 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX1P83916 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX1P83916 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX1P83916 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CBX1P83916 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CBX1P83916 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CBX1P83916 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CBX1P83916 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CBX1P83916 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CBX1P83916 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX1P83916 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX1P83916 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX1P83916 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX1P83916 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX1P83916 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX1P83916 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX1P83916 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX1P83916 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX1P83916 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX1P83916 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX1P83916 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX1P83916 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX1P83916 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX1P83916 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX1P83916 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX1P83916 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX1P83916 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX1P83916 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX1P83916 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX1P83916 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX1P83916 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX1P83916 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX1P83916 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX1P83916 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX1P83916 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX1P83916 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX1P83916 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX1P83916 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX1P83916 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX1P83916 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX1P83916 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX1P83916 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX1P83916 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBX1P83916 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBX1P83916 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CBX1P83916 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX1P83916 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX1P83916 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX1P83916 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX1P83916 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX1P83916 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX1P83916 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX1P83916 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX1P83916 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX1P83916 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CBX1P83916 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBX1P83916 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBX1P83916 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBX1P83916 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBX1P83916 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBX1P83916 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBX1P83916 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms