Protein–RNA interactions for Protein: P78385

KRT83, Keratin, type II cuticular Hb3, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT83P78385 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT83P78385 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT83P78385 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT83P78385 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT83P78385 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT83P78385 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT83P78385 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT83P78385 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT83P78385 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT83P78385 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT83P78385 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT83P78385 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT83P78385 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT83P78385 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT83P78385 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT83P78385 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT83P78385 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT83P78385 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT83P78385 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT83P78385 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT83P78385 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT83P78385 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT83P78385 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT83P78385 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT83P78385 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT83P78385 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT83P78385 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT83P78385 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT83P78385 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT83P78385 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT83P78385 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT83P78385 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT83P78385 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT83P78385 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT83P78385 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT83P78385 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT83P78385 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT83P78385 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT83P78385 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT83P78385 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT83P78385 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT83P78385 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT83P78385 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT83P78385 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT83P78385 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT83P78385 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT83P78385 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT83P78385 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT83P78385 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT83P78385 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT83P78385 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT83P78385 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT83P78385 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT83P78385 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT83P78385 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT83P78385 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT83P78385 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT83P78385 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT83P78385 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT83P78385 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT83P78385 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT83P78385 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT83P78385 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT83P78385 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT83P78385 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT83P78385 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT83P78385 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT83P78385 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT83P78385 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT83P78385 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT83P78385 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT83P78385 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT83P78385 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT83P78385 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT83P78385 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT83P78385 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT83P78385 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT83P78385 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT83P78385 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT83P78385 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT83P78385 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT83P78385 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT83P78385 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT83P78385 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT83P78385 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT83P78385 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT83P78385 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT83P78385 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT83P78385 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT83P78385 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT83P78385 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT83P78385 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT83P78385 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT83P78385 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT83P78385 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT83P78385 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT83P78385 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT83P78385 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT83P78385 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT83P78385 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms