Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEF1A1P68104 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EEF1A1P68104 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EEF1A1P68104 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EEF1A1P68104 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.33■■□□□ 1
EEF1A1P68104 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1A1P68104 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1A1P68104 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1A1P68104 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1A1P68104 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1A1P68104 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1A1P68104 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1A1P68104 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EEF1A1P68104 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1A1P68104 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1A1P68104 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1A1P68104 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1A1P68104 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1A1P68104 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1A1P68104 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1A1P68104 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1A1P68104 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1A1P68104 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1A1P68104 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1A1P68104 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1A1P68104 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1A1P68104 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1A1P68104 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1A1P68104 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1A1P68104 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1A1P68104 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1A1P68104 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1A1P68104 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1A1P68104 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1A1P68104 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1A1P68104 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1A1P68104 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EEF1A1P68104 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1A1P68104 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1A1P68104 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1A1P68104 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1A1P68104 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1A1P68104 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1A1P68104 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EEF1A1P68104 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1A1P68104 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1A1P68104 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1A1P68104 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1A1P68104 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1A1P68104 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1A1P68104 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1A1P68104 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1A1P68104 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1A1P68104 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1A1P68104 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1A1P68104 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EEF1A1P68104 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EEF1A1P68104 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EEF1A1P68104 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EEF1A1P68104 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1A1P68104 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1A1P68104 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1A1P68104 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1A1P68104 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1A1P68104 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1A1P68104 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1A1P68104 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1A1P68104 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1A1P68104 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEF1A1P68104 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms