Protein–RNA interactions for Protein: P62837

UBE2D2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D2P62837 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2D2P62837 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2D2P62837 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms