Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARF6P62330 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARF6P62330 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARF6P62330 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARF6P62330 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARF6P62330 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARF6P62330 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARF6P62330 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ARF6P62330 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARF6P62330 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARF6P62330 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARF6P62330 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARF6P62330 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARF6P62330 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARF6P62330 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARF6P62330 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARF6P62330 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARF6P62330 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARF6P62330 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARF6P62330 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARF6P62330 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARF6P62330 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARF6P62330 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARF6P62330 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARF6P62330 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARF6P62330 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARF6P62330 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARF6P62330 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARF6P62330 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARF6P62330 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARF6P62330 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ARF6P62330 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ARF6P62330 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARF6P62330 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARF6P62330 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARF6P62330 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARF6P62330 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARF6P62330 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARF6P62330 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARF6P62330 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARF6P62330 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARF6P62330 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARF6P62330 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARF6P62330 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARF6P62330 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARF6P62330 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARF6P62330 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARF6P62330 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARF6P62330 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARF6P62330 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARF6P62330 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARF6P62330 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARF6P62330 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARF6P62330 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARF6P62330 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARF6P62330 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARF6P62330 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARF6P62330 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARF6P62330 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARF6P62330 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARF6P62330 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARF6P62330 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARF6P62330 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARF6P62330 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARF6P62330 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ARF6P62330 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ARF6P62330 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ARF6P62330 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARF6P62330 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ARF6P62330 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ARF6P62330 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ARF6P62330 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARF6P62330 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARF6P62330 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ARF6P62330 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARF6P62330 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARF6P62330 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARF6P62330 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARF6P62330 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ARF6P62330 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARF6P62330 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARF6P62330 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARF6P62330 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARF6P62330 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARF6P62330 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARF6P62330 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARF6P62330 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARF6P62330 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ARF6P62330 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARF6P62330 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARF6P62330 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARF6P62330 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARF6P62330 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARF6P62330 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ARF6P62330 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARF6P62330 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARF6P62330 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARF6P62330 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARF6P62330 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARF6P62330 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms