Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS29P62273 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS29P62273 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS29P62273 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS29P62273 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPS29P62273 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS29P62273 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS29P62273 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS29P62273 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS29P62273 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS29P62273 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS29P62273 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS29P62273 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS29P62273 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS29P62273 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS29P62273 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS29P62273 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS29P62273 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS29P62273 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS29P62273 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS29P62273 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS29P62273 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS29P62273 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPS29P62273 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RPS29P62273 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RPS29P62273 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RPS29P62273 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RPS29P62273 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RPS29P62273 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RPS29P62273 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RPS29P62273 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RPS29P62273 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RPS29P62273 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RPS29P62273 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RPS29P62273 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RPS29P62273 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RPS29P62273 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RPS29P62273 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RPS29P62273 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RPS29P62273 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RPS29P62273 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RPS29P62273 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RPS29P62273 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RPS29P62273 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RPS29P62273 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RPS29P62273 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RPS29P62273 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RPS29P62273 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RPS29P62273 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RPS29P62273 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RPS29P62273 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RPS29P62273 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RPS29P62273 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RPS29P62273 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RPS29P62273 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RPS29P62273 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RPS29P62273 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RPS29P62273 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RPS29P62273 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RPS29P62273 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RPS29P62273 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RPS29P62273 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RPS29P62273 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RPS29P62273 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RPS29P62273 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RPS29P62273 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
RPS29P62273 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RPS29P62273 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPS29P62273 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPS29P62273 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPS29P62273 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPS29P62273 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPS29P62273 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPS29P62273 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RPS29P62273 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPS29P62273 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RPS29P62273 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPS29P62273 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPS29P62273 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPS29P62273 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPS29P62273 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPS29P62273 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPS29P62273 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPS29P62273 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPS29P62273 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPS29P62273 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPS29P62273 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPS29P62273 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPS29P62273 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPS29P62273 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPS29P62273 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPS29P62273 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPS29P62273 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPS29P62273 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPS29P62273 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPS29P62273 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPS29P62273 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPS29P62273 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPS29P62273 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPS29P62273 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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