Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN2P57739 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN2P57739 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN2P57739 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN2P57739 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN2P57739 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN2P57739 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN2P57739 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN2P57739 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN2P57739 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN2P57739 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN2P57739 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN2P57739 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN2P57739 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN2P57739 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN2P57739 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN2P57739 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN2P57739 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN2P57739 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN2P57739 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN2P57739 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN2P57739 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN2P57739 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN2P57739 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms