Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSCP56915 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSCP56915 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSCP56915 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSCP56915 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSCP56915 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GSCP56915 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSCP56915 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSCP56915 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GSCP56915 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSCP56915 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSCP56915 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSCP56915 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSCP56915 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSCP56915 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSCP56915 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSCP56915 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSCP56915 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSCP56915 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GSCP56915 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSCP56915 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSCP56915 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSCP56915 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSCP56915 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSCP56915 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSCP56915 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSCP56915 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSCP56915 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSCP56915 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSCP56915 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GSCP56915 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSCP56915 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSCP56915 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSCP56915 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSCP56915 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSCP56915 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSCP56915 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSCP56915 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSCP56915 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSCP56915 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSCP56915 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSCP56915 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSCP56915 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSCP56915 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSCP56915 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSCP56915 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSCP56915 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSCP56915 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSCP56915 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSCP56915 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSCP56915 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSCP56915 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSCP56915 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GSCP56915 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GSCP56915 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GSCP56915 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSCP56915 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSCP56915 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSCP56915 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSCP56915 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSCP56915 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSCP56915 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSCP56915 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GSCP56915 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSCP56915 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSCP56915 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GSCP56915 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSCP56915 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSCP56915 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSCP56915 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSCP56915 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSCP56915 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSCP56915 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSCP56915 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSCP56915 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSCP56915 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSCP56915 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSCP56915 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSCP56915 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSCP56915 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSCP56915 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSCP56915 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSCP56915 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSCP56915 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSCP56915 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSCP56915 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSCP56915 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSCP56915 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSCP56915 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSCP56915 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSCP56915 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSCP56915 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSCP56915 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GSCP56915 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSCP56915 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSCP56915 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSCP56915 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GSCP56915 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSCP56915 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSCP56915 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms