Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOX10P56693 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOX10P56693 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOX10P56693 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOX10P56693 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOX10P56693 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOX10P56693 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOX10P56693 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOX10P56693 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOX10P56693 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SOX10P56693 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SOX10P56693 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOX10P56693 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOX10P56693 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX10P56693 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX10P56693 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX10P56693 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX10P56693 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX10P56693 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX10P56693 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX10P56693 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX10P56693 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX10P56693 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOX10P56693 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOX10P56693 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOX10P56693 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOX10P56693 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SOX10P56693 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SOX10P56693 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOX10P56693 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SOX10P56693 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SOX10P56693 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SOX10P56693 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SOX10P56693 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SOX10P56693 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SOX10P56693 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOX10P56693 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOX10P56693 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOX10P56693 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOX10P56693 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOX10P56693 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOX10P56693 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOX10P56693 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOX10P56693 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOX10P56693 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOX10P56693 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOX10P56693 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOX10P56693 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOX10P56693 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOX10P56693 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOX10P56693 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOX10P56693 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOX10P56693 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX10P56693 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX10P56693 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX10P56693 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX10P56693 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX10P56693 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX10P56693 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX10P56693 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX10P56693 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX10P56693 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX10P56693 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX10P56693 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX10P56693 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX10P56693 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX10P56693 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX10P56693 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX10P56693 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX10P56693 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX10P56693 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX10P56693 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX10P56693 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX10P56693 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX10P56693 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX10P56693 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX10P56693 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX10P56693 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX10P56693 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX10P56693 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX10P56693 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX10P56693 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX10P56693 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX10P56693 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX10P56693 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX10P56693 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOX10P56693 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOX10P56693 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SOX10P56693 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SOX10P56693 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SOX10P56693 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOX10P56693 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOX10P56693 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOX10P56693 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOX10P56693 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOX10P56693 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOX10P56693 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOX10P56693 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOX10P56693 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOX10P56693 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms