Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
AFDNP55196 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
AFDNP55196 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
AFDNP55196 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
AFDNP55196 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
AFDNP55196 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
AFDNP55196 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
AFDNP55196 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
AFDNP55196 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
AFDNP55196 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
AFDNP55196 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
AFDNP55196 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
AFDNP55196 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
AFDNP55196 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
AFDNP55196 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
AFDNP55196 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
AFDNP55196 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
AFDNP55196 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
AFDNP55196 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
AFDNP55196 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
AFDNP55196 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
AFDNP55196 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
AFDNP55196 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
AFDNP55196 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
AFDNP55196 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
AFDNP55196 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
AFDNP55196 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
AFDNP55196 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
AFDNP55196 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
AFDNP55196 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
AFDNP55196 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
AFDNP55196 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
AFDNP55196 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
AFDNP55196 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
AFDNP55196 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
AFDNP55196 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
AFDNP55196 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
AFDNP55196 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
AFDNP55196 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
AFDNP55196 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
AFDNP55196 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
AFDNP55196 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
AFDNP55196 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
AFDNP55196 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
AFDNP55196 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
AFDNP55196 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
AFDNP55196 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
AFDNP55196 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
AFDNP55196 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
AFDNP55196 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
AFDNP55196 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
AFDNP55196 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
AFDNP55196 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
AFDNP55196 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AFDNP55196 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
AFDNP55196 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AFDNP55196 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
AFDNP55196 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
AFDNP55196 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AFDNP55196 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AFDNP55196 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
AFDNP55196 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
AFDNP55196 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
AFDNP55196 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
AFDNP55196 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AFDNP55196 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
AFDNP55196 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
AFDNP55196 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AFDNP55196 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
AFDNP55196 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
AFDNP55196 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
AFDNP55196 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
AFDNP55196 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AFDNP55196 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
AFDNP55196 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AFDNP55196 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
AFDNP55196 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
AFDNP55196 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
AFDNP55196 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
AFDNP55196 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
AFDNP55196 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
AFDNP55196 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
AFDNP55196 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
AFDNP55196 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
AFDNP55196 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AFDNP55196 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
AFDNP55196 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AFDNP55196 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AFDNP55196 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
AFDNP55196 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
AFDNP55196 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
AFDNP55196 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
AFDNP55196 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
AFDNP55196 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AFDNP55196 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AFDNP55196 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
AFDNP55196 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AFDNP55196 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
AFDNP55196 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
AFDNP55196 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms