Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHB4P54760 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EPHB4P54760 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EPHB4P54760 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms