Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRISP3P54108 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRISP3P54108 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms