Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPAP53621 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPAP53621 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPAP53621 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPAP53621 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPAP53621 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPAP53621 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPAP53621 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPAP53621 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPAP53621 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPAP53621 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPAP53621 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPAP53621 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COPAP53621 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COPAP53621 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPAP53621 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPAP53621 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPAP53621 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COPAP53621 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPAP53621 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COPAP53621 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COPAP53621 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COPAP53621 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPAP53621 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COPAP53621 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPAP53621 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPAP53621 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPAP53621 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPAP53621 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPAP53621 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COPAP53621 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPAP53621 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPAP53621 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPAP53621 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPAP53621 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPAP53621 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPAP53621 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPAP53621 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPAP53621 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
COPAP53621 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPAP53621 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPAP53621 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
COPAP53621 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
COPAP53621 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
COPAP53621 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
COPAP53621 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPAP53621 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPAP53621 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPAP53621 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPAP53621 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPAP53621 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPAP53621 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPAP53621 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPAP53621 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPAP53621 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPAP53621 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPAP53621 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPAP53621 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPAP53621 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPAP53621 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COPAP53621 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPAP53621 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPAP53621 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPAP53621 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPAP53621 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPAP53621 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPAP53621 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPAP53621 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPAP53621 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COPAP53621 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPAP53621 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPAP53621 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPAP53621 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPAP53621 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
COPAP53621 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPAP53621 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPAP53621 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPAP53621 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPAP53621 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPAP53621 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPAP53621 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPAP53621 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPAP53621 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPAP53621 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPAP53621 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPAP53621 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPAP53621 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPAP53621 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPAP53621 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPAP53621 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPAP53621 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPAP53621 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPAP53621 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPAP53621 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPAP53621 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPAP53621 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPAP53621 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPAP53621 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPAP53621 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPAP53621 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms