Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOSBP53539 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOSBP53539 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOSBP53539 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOSBP53539 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOSBP53539 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOSBP53539 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOSBP53539 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOSBP53539 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOSBP53539 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOSBP53539 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FOSBP53539 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FOSBP53539 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FOSBP53539 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FOSBP53539 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FOSBP53539 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FOSBP53539 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOSBP53539 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOSBP53539 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOSBP53539 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOSBP53539 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOSBP53539 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOSBP53539 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOSBP53539 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOSBP53539 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FOSBP53539 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOSBP53539 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOSBP53539 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOSBP53539 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOSBP53539 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOSBP53539 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOSBP53539 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOSBP53539 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOSBP53539 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOSBP53539 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOSBP53539 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOSBP53539 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOSBP53539 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOSBP53539 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOSBP53539 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOSBP53539 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOSBP53539 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FOSBP53539 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOSBP53539 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOSBP53539 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOSBP53539 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOSBP53539 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOSBP53539 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOSBP53539 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOSBP53539 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOSBP53539 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOSBP53539 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOSBP53539 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOSBP53539 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOSBP53539 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOSBP53539 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOSBP53539 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOSBP53539 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOSBP53539 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOSBP53539 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOSBP53539 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOSBP53539 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOSBP53539 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOSBP53539 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOSBP53539 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOSBP53539 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOSBP53539 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOSBP53539 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOSBP53539 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOSBP53539 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOSBP53539 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOSBP53539 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOSBP53539 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOSBP53539 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOSBP53539 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOSBP53539 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOSBP53539 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOSBP53539 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOSBP53539 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOSBP53539 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOSBP53539 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOSBP53539 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOSBP53539 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOSBP53539 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOSBP53539 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOSBP53539 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOSBP53539 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOSBP53539 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOSBP53539 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FOSBP53539 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOSBP53539 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOSBP53539 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOSBP53539 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOSBP53539 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOSBP53539 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOSBP53539 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOSBP53539 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOSBP53539 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOSBP53539 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOSBP53539 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms