Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EFNA3P52797 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFNA3P52797 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms