Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGS4P49798 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGS4P49798 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGS4P49798 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGS4P49798 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGS4P49798 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGS4P49798 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGS4P49798 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGS4P49798 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGS4P49798 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGS4P49798 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGS4P49798 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGS4P49798 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGS4P49798 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RGS4P49798 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGS4P49798 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGS4P49798 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGS4P49798 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGS4P49798 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RGS4P49798 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGS4P49798 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGS4P49798 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGS4P49798 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGS4P49798 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGS4P49798 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGS4P49798 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGS4P49798 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGS4P49798 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGS4P49798 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGS4P49798 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGS4P49798 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGS4P49798 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RGS4P49798 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RGS4P49798 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RGS4P49798 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGS4P49798 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGS4P49798 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGS4P49798 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGS4P49798 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGS4P49798 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGS4P49798 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGS4P49798 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGS4P49798 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGS4P49798 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGS4P49798 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGS4P49798 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGS4P49798 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGS4P49798 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGS4P49798 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGS4P49798 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RGS4P49798 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGS4P49798 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGS4P49798 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGS4P49798 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGS4P49798 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGS4P49798 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGS4P49798 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGS4P49798 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGS4P49798 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGS4P49798 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGS4P49798 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGS4P49798 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGS4P49798 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGS4P49798 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGS4P49798 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGS4P49798 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGS4P49798 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGS4P49798 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGS4P49798 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGS4P49798 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RGS4P49798 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGS4P49798 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGS4P49798 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGS4P49798 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGS4P49798 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGS4P49798 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGS4P49798 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGS4P49798 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RGS4P49798 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGS4P49798 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGS4P49798 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGS4P49798 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGS4P49798 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGS4P49798 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGS4P49798 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGS4P49798 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGS4P49798 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGS4P49798 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGS4P49798 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGS4P49798 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGS4P49798 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGS4P49798 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGS4P49798 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGS4P49798 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGS4P49798 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGS4P49798 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGS4P49798 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGS4P49798 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGS4P49798 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGS4P49798 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms