Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PITPNBP48739 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms