Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XCR1P46094 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XCR1P46094 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XCR1P46094 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XCR1P46094 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XCR1P46094 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XCR1P46094 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XCR1P46094 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XCR1P46094 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XCR1P46094 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XCR1P46094 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XCR1P46094 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XCR1P46094 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XCR1P46094 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XCR1P46094 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XCR1P46094 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
XCR1P46094 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XCR1P46094 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XCR1P46094 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XCR1P46094 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XCR1P46094 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XCR1P46094 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XCR1P46094 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XCR1P46094 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XCR1P46094 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XCR1P46094 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XCR1P46094 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
XCR1P46094 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XCR1P46094 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XCR1P46094 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XCR1P46094 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XCR1P46094 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XCR1P46094 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XCR1P46094 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
XCR1P46094 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22■■□□□ 1.11
XCR1P46094 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XCR1P46094 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XCR1P46094 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XCR1P46094 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XCR1P46094 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XCR1P46094 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XCR1P46094 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XCR1P46094 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XCR1P46094 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XCR1P46094 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XCR1P46094 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XCR1P46094 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XCR1P46094 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XCR1P46094 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XCR1P46094 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XCR1P46094 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XCR1P46094 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XCR1P46094 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XCR1P46094 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
XCR1P46094 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XCR1P46094 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XCR1P46094 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XCR1P46094 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XCR1P46094 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XCR1P46094 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XCR1P46094 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XCR1P46094 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XCR1P46094 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XCR1P46094 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XCR1P46094 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XCR1P46094 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XCR1P46094 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XCR1P46094 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XCR1P46094 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XCR1P46094 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XCR1P46094 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XCR1P46094 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XCR1P46094 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XCR1P46094 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XCR1P46094 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XCR1P46094 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XCR1P46094 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XCR1P46094 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XCR1P46094 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XCR1P46094 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XCR1P46094 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XCR1P46094 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XCR1P46094 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XCR1P46094 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XCR1P46094 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XCR1P46094 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XCR1P46094 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XCR1P46094 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XCR1P46094 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XCR1P46094 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XCR1P46094 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XCR1P46094 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XCR1P46094 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XCR1P46094 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XCR1P46094 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XCR1P46094 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XCR1P46094 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XCR1P46094 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XCR1P46094 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XCR1P46094 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms