Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIK3CAP42336 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms