Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LIPAP38571 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LIPAP38571 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LIPAP38571 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LIPAP38571 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LIPAP38571 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LIPAP38571 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
LIPAP38571 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIPAP38571 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIPAP38571 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIPAP38571 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIPAP38571 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIPAP38571 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIPAP38571 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIPAP38571 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIPAP38571 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIPAP38571 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIPAP38571 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIPAP38571 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIPAP38571 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LIPAP38571 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIPAP38571 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIPAP38571 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIPAP38571 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIPAP38571 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIPAP38571 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIPAP38571 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIPAP38571 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIPAP38571 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIPAP38571 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIPAP38571 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LIPAP38571 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIPAP38571 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LIPAP38571 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIPAP38571 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIPAP38571 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIPAP38571 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIPAP38571 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIPAP38571 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LIPAP38571 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIPAP38571 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIPAP38571 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIPAP38571 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIPAP38571 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LIPAP38571 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIPAP38571 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIPAP38571 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIPAP38571 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIPAP38571 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIPAP38571 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIPAP38571 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIPAP38571 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIPAP38571 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIPAP38571 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIPAP38571 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIPAP38571 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIPAP38571 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIPAP38571 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIPAP38571 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIPAP38571 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LIPAP38571 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LIPAP38571 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LIPAP38571 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LIPAP38571 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LIPAP38571 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LIPAP38571 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LIPAP38571 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LIPAP38571 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LIPAP38571 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LIPAP38571 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LIPAP38571 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LIPAP38571 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LIPAP38571 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LIPAP38571 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LIPAP38571 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LIPAP38571 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LIPAP38571 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LIPAP38571 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LIPAP38571 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LIPAP38571 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LIPAP38571 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LIPAP38571 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LIPAP38571 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LIPAP38571 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LIPAP38571 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LIPAP38571 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LIPAP38571 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LIPAP38571 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LIPAP38571 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LIPAP38571 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LIPAP38571 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LIPAP38571 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LIPAP38571 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LIPAP38571 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LIPAP38571 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LIPAP38571 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LIPAP38571 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LIPAP38571 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LIPAP38571 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LIPAP38571 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms