Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2IP36954 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2IP36954 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2IP36954 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2IP36954 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2IP36954 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2IP36954 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2IP36954 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2IP36954 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2IP36954 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2IP36954 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2IP36954 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2IP36954 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2IP36954 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2IP36954 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2IP36954 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2IP36954 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2IP36954 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
POLR2IP36954 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms