Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL4P36578 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL4P36578 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL4P36578 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL4P36578 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL4P36578 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL4P36578 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL4P36578 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL4P36578 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL4P36578 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL4P36578 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL4P36578 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL4P36578 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL4P36578 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL4P36578 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL4P36578 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL4P36578 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL4P36578 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL4P36578 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL4P36578 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL4P36578 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL4P36578 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL4P36578 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL4P36578 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL4P36578 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL4P36578 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL4P36578 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL4P36578 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL4P36578 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL4P36578 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL4P36578 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL4P36578 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL4P36578 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL4P36578 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL4P36578 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL4P36578 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL4P36578 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL4P36578 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL4P36578 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL4P36578 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL4P36578 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL4P36578 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL4P36578 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL4P36578 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL4P36578 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL4P36578 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL4P36578 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL4P36578 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL4P36578 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL4P36578 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL4P36578 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL4P36578 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL4P36578 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL4P36578 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL4P36578 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL4P36578 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL4P36578 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL4P36578 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL4P36578 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL4P36578 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL4P36578 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL4P36578 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL4P36578 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL4P36578 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL4P36578 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL4P36578 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPL4P36578 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL4P36578 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL4P36578 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL4P36578 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL4P36578 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL4P36578 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL4P36578 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL4P36578 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL4P36578 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL4P36578 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL4P36578 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL4P36578 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL4P36578 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL4P36578 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL4P36578 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL4P36578 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL4P36578 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL4P36578 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL4P36578 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL4P36578 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL4P36578 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL4P36578 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL4P36578 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL4P36578 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL4P36578 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL4P36578 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL4P36578 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL4P36578 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL4P36578 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL4P36578 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL4P36578 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL4P36578 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL4P36578 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL4P36578 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms