Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCK1P35558 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCK1P35558 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCK1P35558 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCK1P35558 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCK1P35558 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCK1P35558 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCK1P35558 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCK1P35558 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCK1P35558 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCK1P35558 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCK1P35558 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCK1P35558 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCK1P35558 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCK1P35558 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCK1P35558 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCK1P35558 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCK1P35558 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCK1P35558 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCK1P35558 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCK1P35558 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCK1P35558 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCK1P35558 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCK1P35558 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCK1P35558 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCK1P35558 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCK1P35558 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCK1P35558 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCK1P35558 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCK1P35558 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCK1P35558 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCK1P35558 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCK1P35558 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCK1P35558 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCK1P35558 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCK1P35558 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCK1P35558 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCK1P35558 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCK1P35558 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCK1P35558 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCK1P35558 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCK1P35558 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCK1P35558 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCK1P35558 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCK1P35558 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCK1P35558 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCK1P35558 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCK1P35558 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCK1P35558 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCK1P35558 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCK1P35558 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCK1P35558 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCK1P35558 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCK1P35558 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCK1P35558 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCK1P35558 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCK1P35558 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCK1P35558 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCK1P35558 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCK1P35558 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCK1P35558 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCK1P35558 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCK1P35558 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCK1P35558 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCK1P35558 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCK1P35558 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCK1P35558 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCK1P35558 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCK1P35558 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCK1P35558 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCK1P35558 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCK1P35558 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCK1P35558 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCK1P35558 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCK1P35558 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCK1P35558 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCK1P35558 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCK1P35558 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCK1P35558 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCK1P35558 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCK1P35558 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCK1P35558 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCK1P35558 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCK1P35558 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCK1P35558 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCK1P35558 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCK1P35558 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCK1P35558 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCK1P35558 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCK1P35558 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCK1P35558 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCK1P35558 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCK1P35558 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCK1P35558 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCK1P35558 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCK1P35558 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCK1P35558 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCK1P35558 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCK1P35558 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCK1P35558 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms