Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD12P35452 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD12P35452 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms