Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RYKP34925 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RYKP34925 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RYKP34925 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RYKP34925 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RYKP34925 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RYKP34925 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RYKP34925 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RYKP34925 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RYKP34925 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RYKP34925 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RYKP34925 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RYKP34925 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RYKP34925 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RYKP34925 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RYKP34925 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RYKP34925 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RYKP34925 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RYKP34925 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RYKP34925 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RYKP34925 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RYKP34925 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RYKP34925 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RYKP34925 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RYKP34925 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RYKP34925 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RYKP34925 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RYKP34925 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RYKP34925 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RYKP34925 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RYKP34925 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RYKP34925 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RYKP34925 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RYKP34925 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RYKP34925 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RYKP34925 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RYKP34925 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RYKP34925 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RYKP34925 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RYKP34925 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RYKP34925 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RYKP34925 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RYKP34925 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RYKP34925 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RYKP34925 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RYKP34925 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RYKP34925 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RYKP34925 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RYKP34925 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RYKP34925 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RYKP34925 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RYKP34925 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RYKP34925 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RYKP34925 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RYKP34925 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RYKP34925 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RYKP34925 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RYKP34925 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RYKP34925 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RYKP34925 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RYKP34925 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RYKP34925 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RYKP34925 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RYKP34925 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RYKP34925 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RYKP34925 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RYKP34925 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RYKP34925 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RYKP34925 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RYKP34925 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RYKP34925 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RYKP34925 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RYKP34925 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RYKP34925 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RYKP34925 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RYKP34925 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RYKP34925 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RYKP34925 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RYKP34925 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RYKP34925 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RYKP34925 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RYKP34925 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RYKP34925 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RYKP34925 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RYKP34925 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RYKP34925 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RYKP34925 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RYKP34925 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RYKP34925 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RYKP34925 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RYKP34925 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RYKP34925 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RYKP34925 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RYKP34925 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RYKP34925 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RYKP34925 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RYKP34925 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RYKP34925 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RYKP34925 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RYKP34925 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms