Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2H1P32780 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms