Protein–RNA interactions for Protein: P30203

CD6, T-cell differentiation antigen CD6, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD6P30203 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD6P30203 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD6P30203 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD6P30203 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD6P30203 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD6P30203 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD6P30203 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD6P30203 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD6P30203 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD6P30203 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD6P30203 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD6P30203 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CD6P30203 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD6P30203 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CD6P30203 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD6P30203 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD6P30203 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD6P30203 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD6P30203 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD6P30203 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD6P30203 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD6P30203 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD6P30203 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD6P30203 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD6P30203 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD6P30203 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD6P30203 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CD6P30203 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD6P30203 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD6P30203 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD6P30203 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD6P30203 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD6P30203 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD6P30203 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD6P30203 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD6P30203 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD6P30203 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD6P30203 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD6P30203 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD6P30203 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CD6P30203 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CD6P30203 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD6P30203 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD6P30203 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD6P30203 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD6P30203 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD6P30203 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD6P30203 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD6P30203 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD6P30203 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD6P30203 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD6P30203 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD6P30203 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CD6P30203 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD6P30203 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD6P30203 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD6P30203 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD6P30203 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD6P30203 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD6P30203 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD6P30203 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD6P30203 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD6P30203 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD6P30203 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD6P30203 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD6P30203 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD6P30203 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CD6P30203 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD6P30203 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD6P30203 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD6P30203 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD6P30203 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD6P30203 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD6P30203 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CD6P30203 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD6P30203 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD6P30203 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD6P30203 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD6P30203 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD6P30203 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD6P30203 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD6P30203 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD6P30203 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD6P30203 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD6P30203 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CD6P30203 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD6P30203 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD6P30203 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD6P30203 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD6P30203 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD6P30203 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD6P30203 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD6P30203 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD6P30203 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD6P30203 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD6P30203 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD6P30203 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD6P30203 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD6P30203 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CD6P30203 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms