Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPHB2P29323 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHB2P29323 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHB2P29323 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHB2P29323 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHB2P29323 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHB2P29323 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHB2P29323 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHB2P29323 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms