Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CD34P28906 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CD34P28906 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CD34P28906 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CD34P28906 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CD34P28906 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CD34P28906 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CD34P28906 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CD34P28906 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CD34P28906 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD34P28906 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD34P28906 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CD34P28906 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD34P28906 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD34P28906 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD34P28906 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD34P28906 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD34P28906 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD34P28906 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD34P28906 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD34P28906 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD34P28906 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD34P28906 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CD34P28906 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CD34P28906 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CD34P28906 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CD34P28906 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CD34P28906 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CD34P28906 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CD34P28906 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CD34P28906 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CD34P28906 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CD34P28906 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CD34P28906 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD34P28906 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD34P28906 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD34P28906 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD34P28906 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD34P28906 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CD34P28906 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CD34P28906 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD34P28906 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD34P28906 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD34P28906 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD34P28906 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD34P28906 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD34P28906 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD34P28906 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD34P28906 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD34P28906 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD34P28906 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD34P28906 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD34P28906 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD34P28906 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD34P28906 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD34P28906 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD34P28906 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD34P28906 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD34P28906 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD34P28906 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD34P28906 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD34P28906 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD34P28906 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD34P28906 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD34P28906 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD34P28906 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD34P28906 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD34P28906 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD34P28906 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD34P28906 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CD34P28906 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD34P28906 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CD34P28906 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD34P28906 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD34P28906 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD34P28906 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD34P28906 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CD34P28906 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD34P28906 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD34P28906 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD34P28906 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD34P28906 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD34P28906 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD34P28906 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CD34P28906 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CD34P28906 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CD34P28906 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CD34P28906 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CD34P28906 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD34P28906 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD34P28906 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD34P28906 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CD34P28906 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD34P28906 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD34P28906 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD34P28906 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD34P28906 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD34P28906 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD34P28906 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD34P28906 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms