Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPREP23469 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPREP23469 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPREP23469 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPREP23469 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPREP23469 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPREP23469 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PTPREP23469 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPREP23469 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPREP23469 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPREP23469 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPREP23469 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPREP23469 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPREP23469 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPREP23469 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPREP23469 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPREP23469 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPREP23469 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPREP23469 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPREP23469 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPREP23469 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPREP23469 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPREP23469 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPREP23469 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPREP23469 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPREP23469 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPREP23469 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPREP23469 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPREP23469 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPREP23469 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPREP23469 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPREP23469 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPREP23469 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPREP23469 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPREP23469 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPREP23469 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPREP23469 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPREP23469 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPREP23469 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPREP23469 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPREP23469 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPREP23469 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPREP23469 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPREP23469 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPREP23469 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPREP23469 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPREP23469 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPREP23469 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPREP23469 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPREP23469 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPREP23469 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPREP23469 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPREP23469 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPREP23469 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPREP23469 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPREP23469 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPREP23469 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPREP23469 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPREP23469 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPREP23469 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPREP23469 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPREP23469 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPREP23469 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPREP23469 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPREP23469 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPREP23469 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPREP23469 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPREP23469 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPREP23469 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPREP23469 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPREP23469 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPREP23469 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPREP23469 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPREP23469 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPREP23469 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPREP23469 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPREP23469 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPREP23469 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPREP23469 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPREP23469 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPREP23469 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPREP23469 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPREP23469 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPREP23469 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPREP23469 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPREP23469 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPREP23469 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPREP23469 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPREP23469 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPREP23469 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPREP23469 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPREP23469 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPREP23469 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPREP23469 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPREP23469 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPREP23469 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPREP23469 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPREP23469 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPREP23469 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPREP23469 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms