Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRP1P21291 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRP1P21291 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRP1P21291 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRP1P21291 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRP1P21291 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRP1P21291 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRP1P21291 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRP1P21291 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRP1P21291 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRP1P21291 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRP1P21291 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms