Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3P19429 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNI3P19429 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms