Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB6P18564 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms