Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FLT1P17948 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FLT1P17948 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FLT1P17948 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FLT1P17948 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FLT1P17948 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FLT1P17948 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FLT1P17948 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FLT1P17948 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FLT1P17948 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FLT1P17948 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FLT1P17948 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FLT1P17948 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FLT1P17948 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FLT1P17948 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FLT1P17948 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FLT1P17948 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FLT1P17948 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
FLT1P17948 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FLT1P17948 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FLT1P17948 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FLT1P17948 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FLT1P17948 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FLT1P17948 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
FLT1P17948 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FLT1P17948 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FLT1P17948 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FLT1P17948 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FLT1P17948 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FLT1P17948 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FLT1P17948 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FLT1P17948 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FLT1P17948 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FLT1P17948 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FLT1P17948 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLT1P17948 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLT1P17948 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLT1P17948 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLT1P17948 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLT1P17948 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLT1P17948 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLT1P17948 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLT1P17948 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLT1P17948 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLT1P17948 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLT1P17948 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLT1P17948 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLT1P17948 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLT1P17948 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLT1P17948 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT1P17948 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT1P17948 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT1P17948 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT1P17948 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT1P17948 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT1P17948 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT1P17948 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT1P17948 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FLT1P17948 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FLT1P17948 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FLT1P17948 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FLT1P17948 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FLT1P17948 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FLT1P17948 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FLT1P17948 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FLT1P17948 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FLT1P17948 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FLT1P17948 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FLT1P17948 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FLT1P17948 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FLT1P17948 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FLT1P17948 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FLT1P17948 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FLT1P17948 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FLT1P17948 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FLT1P17948 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FLT1P17948 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FLT1P17948 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FLT1P17948 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FLT1P17948 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FLT1P17948 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FLT1P17948 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FLT1P17948 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FLT1P17948 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FLT1P17948 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FLT1P17948 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FLT1P17948 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FLT1P17948 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FLT1P17948 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FLT1P17948 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FLT1P17948 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FLT1P17948 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FLT1P17948 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FLT1P17948 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FLT1P17948 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FLT1P17948 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FLT1P17948 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FLT1P17948 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FLT1P17948 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FLT1P17948 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms