Protein–RNA interactions for Protein: P17066

HSPA6, Heat shock 70 kDa protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA6P17066 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HSPA6P17066 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HSPA6P17066 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HSPA6P17066 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HSPA6P17066 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HSPA6P17066 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HSPA6P17066 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HSPA6P17066 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HSPA6P17066 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HSPA6P17066 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HSPA6P17066 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HSPA6P17066 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HSPA6P17066 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HSPA6P17066 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HSPA6P17066 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HSPA6P17066 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HSPA6P17066 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HSPA6P17066 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HSPA6P17066 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HSPA6P17066 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HSPA6P17066 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HSPA6P17066 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms