Protein–RNA interactions for Protein: P13349

MYF5, Myogenic factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF5P13349 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYF5P13349 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYF5P13349 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MYF5P13349 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYF5P13349 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYF5P13349 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYF5P13349 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYF5P13349 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYF5P13349 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MYF5P13349 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYF5P13349 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYF5P13349 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MYF5P13349 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYF5P13349 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYF5P13349 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYF5P13349 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYF5P13349 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYF5P13349 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYF5P13349 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYF5P13349 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYF5P13349 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYF5P13349 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYF5P13349 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYF5P13349 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYF5P13349 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYF5P13349 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYF5P13349 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYF5P13349 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYF5P13349 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYF5P13349 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYF5P13349 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYF5P13349 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYF5P13349 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYF5P13349 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYF5P13349 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYF5P13349 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYF5P13349 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYF5P13349 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYF5P13349 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYF5P13349 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MYF5P13349 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYF5P13349 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYF5P13349 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MYF5P13349 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYF5P13349 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYF5P13349 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYF5P13349 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYF5P13349 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MYF5P13349 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYF5P13349 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYF5P13349 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYF5P13349 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYF5P13349 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYF5P13349 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYF5P13349 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYF5P13349 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYF5P13349 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYF5P13349 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYF5P13349 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYF5P13349 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYF5P13349 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYF5P13349 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYF5P13349 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYF5P13349 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYF5P13349 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYF5P13349 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYF5P13349 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYF5P13349 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYF5P13349 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYF5P13349 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYF5P13349 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYF5P13349 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYF5P13349 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYF5P13349 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYF5P13349 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYF5P13349 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYF5P13349 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYF5P13349 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYF5P13349 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYF5P13349 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYF5P13349 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYF5P13349 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYF5P13349 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYF5P13349 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MYF5P13349 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MYF5P13349 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYF5P13349 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYF5P13349 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYF5P13349 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYF5P13349 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYF5P13349 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYF5P13349 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYF5P13349 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYF5P13349 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MYF5P13349 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYF5P13349 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYF5P13349 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYF5P13349 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYF5P13349 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYF5P13349 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms