Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKIP12755 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKIP12755 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKIP12755 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKIP12755 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKIP12755 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKIP12755 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKIP12755 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKIP12755 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKIP12755 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKIP12755 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKIP12755 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKIP12755 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKIP12755 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKIP12755 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKIP12755 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKIP12755 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKIP12755 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKIP12755 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SKIP12755 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKIP12755 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKIP12755 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKIP12755 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKIP12755 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKIP12755 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKIP12755 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SKIP12755 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKIP12755 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKIP12755 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKIP12755 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKIP12755 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKIP12755 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKIP12755 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SKIP12755 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SKIP12755 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKIP12755 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKIP12755 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKIP12755 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKIP12755 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SKIP12755 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKIP12755 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKIP12755 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SKIP12755 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKIP12755 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SKIP12755 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKIP12755 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKIP12755 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKIP12755 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKIP12755 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SKIP12755 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKIP12755 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKIP12755 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKIP12755 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKIP12755 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKIP12755 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKIP12755 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKIP12755 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKIP12755 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SKIP12755 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKIP12755 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKIP12755 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SKIP12755 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKIP12755 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKIP12755 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKIP12755 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKIP12755 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKIP12755 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKIP12755 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKIP12755 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKIP12755 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKIP12755 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKIP12755 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKIP12755 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKIP12755 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKIP12755 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKIP12755 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SKIP12755 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKIP12755 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKIP12755 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKIP12755 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKIP12755 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKIP12755 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIP12755 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIP12755 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIP12755 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIP12755 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIP12755 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIP12755 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIP12755 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIP12755 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIP12755 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIP12755 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIP12755 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIP12755 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIP12755 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKIP12755 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKIP12755 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKIP12755 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKIP12755 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKIP12755 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms