Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MS4A1P11836 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms