Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR35P0CG20 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms