Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITGB1P05556 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB1P05556 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms