Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRM2P04554 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRM2P04554 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRM2P04554 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRM2P04554 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRM2P04554 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRM2P04554 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRM2P04554 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRM2P04554 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRM2P04554 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRM2P04554 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRM2P04554 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRM2P04554 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRM2P04554 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRM2P04554 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRM2P04554 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRM2P04554 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRM2P04554 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRM2P04554 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRM2P04554 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRM2P04554 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PRM2P04554 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRM2P04554 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRM2P04554 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRM2P04554 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PRM2P04554 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRM2P04554 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRM2P04554 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PRM2P04554 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PRM2P04554 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRM2P04554 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRM2P04554 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRM2P04554 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRM2P04554 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRM2P04554 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRM2P04554 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRM2P04554 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRM2P04554 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PRM2P04554 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRM2P04554 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRM2P04554 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRM2P04554 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRM2P04554 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRM2P04554 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRM2P04554 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRM2P04554 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PRM2P04554 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRM2P04554 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRM2P04554 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRM2P04554 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRM2P04554 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRM2P04554 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRM2P04554 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRM2P04554 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRM2P04554 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRM2P04554 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRM2P04554 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRM2P04554 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRM2P04554 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRM2P04554 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRM2P04554 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRM2P04554 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRM2P04554 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRM2P04554 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRM2P04554 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRM2P04554 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRM2P04554 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRM2P04554 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRM2P04554 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRM2P04554 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRM2P04554 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRM2P04554 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRM2P04554 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRM2P04554 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRM2P04554 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRM2P04554 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRM2P04554 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRM2P04554 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRM2P04554 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRM2P04554 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRM2P04554 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRM2P04554 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRM2P04554 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRM2P04554 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRM2P04554 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRM2P04554 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRM2P04554 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRM2P04554 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRM2P04554 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRM2P04554 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRM2P04554 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRM2P04554 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRM2P04554 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRM2P04554 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PRM2P04554 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PRM2P04554 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRM2P04554 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRM2P04554 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRM2P04554 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRM2P04554 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms