Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYCNP04198 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYCNP04198 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYCNP04198 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYCNP04198 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYCNP04198 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYCNP04198 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYCNP04198 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYCNP04198 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYCNP04198 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYCNP04198 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYCNP04198 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYCNP04198 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYCNP04198 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MYCNP04198 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYCNP04198 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYCNP04198 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYCNP04198 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYCNP04198 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYCNP04198 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYCNP04198 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYCNP04198 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYCNP04198 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYCNP04198 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYCNP04198 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYCNP04198 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYCNP04198 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYCNP04198 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MYCNP04198 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYCNP04198 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYCNP04198 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYCNP04198 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYCNP04198 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYCNP04198 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYCNP04198 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYCNP04198 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYCNP04198 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYCNP04198 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYCNP04198 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYCNP04198 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYCNP04198 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYCNP04198 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYCNP04198 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MYCNP04198 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYCNP04198 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MYCNP04198 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYCNP04198 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MYCNP04198 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MYCNP04198 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYCNP04198 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYCNP04198 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYCNP04198 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYCNP04198 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYCNP04198 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYCNP04198 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYCNP04198 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYCNP04198 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYCNP04198 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYCNP04198 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYCNP04198 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYCNP04198 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYCNP04198 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MYCNP04198 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYCNP04198 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYCNP04198 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYCNP04198 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYCNP04198 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYCNP04198 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYCNP04198 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYCNP04198 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYCNP04198 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MYCNP04198 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYCNP04198 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MYCNP04198 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYCNP04198 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYCNP04198 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MYCNP04198 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYCNP04198 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYCNP04198 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MYCNP04198 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYCNP04198 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYCNP04198 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYCNP04198 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYCNP04198 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYCNP04198 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYCNP04198 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYCNP04198 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYCNP04198 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYCNP04198 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYCNP04198 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYCNP04198 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYCNP04198 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYCNP04198 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYCNP04198 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYCNP04198 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MYCNP04198 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYCNP04198 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYCNP04198 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYCNP04198 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYCNP04198 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms